Drosophila -laboratorio

Johdanto
Tampereen Drosophila-laboratorio edistää Drosophila melanogaster -malliorganismin (eli banaanikärpäsen) käyttöä biotieteissä. Drosophilaa on helppoa ja edullista kasvattaa laboratoriossa, se tuottaa lukuisia jälkeläisiä ja sillä on lyhyt (noin 10 päivää) sukupolvien välinen aika. Selkärangattomana Drosophila on eettisesti ihanteellinen eläinmalli.

Drosophila on erittäin hyödyllinen työkalu erilaisten biologisten prosessien tutkimiseen. Drosophilan genomilla on alhainen päällekkäisyys; yksittäiset mutantit paljastavat todennäköisesti kiinnostavat fenotyypit. Lisäksi erittäin suuri määrä biologisia prosesseja on säilynyt korkeasti toisiaan vastaavina kärpästen ja nisäkkäiden välillä, ja 75 %:lla tunnetuista ihmisen geneettisten sairauksien geeneistä on homologeja kärpäsessä.

Kärpästen suurin etu on geneettisen analyysin yksinkertaisuus ja mittakaava. Viime vuosikymmeninä on kehitetty monia molekyyligeneettisiä tekniikoita, mukaan lukien RNA-interferenssi (RNAi). Mutantteja, siirtogeenisiä linjoja ja muita ”työkalu”-linjoja on saatavilla kantakeskuksista, kuten Bloomington Drosophila Stock Center (BDSC) ja Exelixis Collection Harvard Medical Schoolissa. Binaariseen GAL4/UAS-järjestelmään perustuvia RNAi-kärpäslinjoja on saatavana kaupallisesti useista keskuksista, mukaan lukien Wienin Drosophila RNAi -keskus (VDRC), NIG-FLY (National Institutes of Genetics, Japan) ja TRIP (Transgeeninen RNAi-projekti) Harvard Medical Schoolissa.chool.

Palvelut
Siirtogeenisten kärpästen luominen
Tampereen Drosophila-laboratorio tarjoaa opastusta plasmidin tekemiseen siirtogeenisten kärpästen luomiseksi ja autamme rekombinantti-DNA:n injektoinnissa alkioihin ja siirtogeenisten kärpäslinjojen tunnistamisessa. Sen jälkeen tarjoamme opastusta siirtogeenien kartoittamiseen risteytyskaavioilla ja/tai käänteis-PCR:llä.

Konsultointi ja opastus koeasetelmista
Tarjoamme opastusta koeasetelmien suunnittelussa mm. sopivien GAL4-ohjattujen kärpäslinjojen valitseminen kudosspesifistä tai yleistä kohdegeenin (-geenien) alasajoa/ekspressiota varten, risteytyskaavioita, kärpäsen fenotyyppejä jne.

Kärpäslinjojen ylläpito
Kärpäslinjojen hankkiminen kantakeskuksista:
Pyynnöstä tarjoamme apua kärpäslinjojen, mukaan lukien mutanttien, siirtogeenisten linjojen, RNAi-linjojen ja muiden ”työkalu”-linjojen valinnassa ja tilaamisessa kantakeskuksista (Bloomington, Harvard, VDRC, NIG-Fly Japan), ja niiden ylläpitoon laitoksessa.
Paikallisesti ylläpidetyt kärpäslinjat:
Monia hyödyllisiä linjoja, kuten lukuisia RNAi- ja GAL4-ohjattuja linjoja ylläpidetään paikallisesti ja ne ovat siksi helposti saatavilla.

Kiitokset
Kaikkien Tampereen Drosophila-laboratorion palveluita käyttäneiden tulee kiittää palvelua ja Biokeskus Suomea julkaisuissaan: "Kirjoittavat kiittävät Biokeskus Suomea (Biocenter Finland) ja Tampereen Drosophila- laboratoriota palvelustaan " tai “The authors acknowledge the Biocenter Finland and Tampere Drosophila facility for their service.”