Tutkimustuotoksia vuodessa
Tutkimustuotoksia vuodessa
Hakutulokset
-
2024
A Multi-Dimensional Approach to Map Disease Relationships Challenges Classical Disease Views
Möbus, L., Serra, A., Fratello, M., Pavel, A., Federico, A. & Greco, D., 5 kesäk. 2024, (E-pub ahead of print) julkaisussa: Advanced science.Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto2 Lataukset (Pure) -
Integrative network analysis suggests prioritised drugs for atopic dermatitis
Federico, A., Möbus, L., Al-Abdulraheem, Z., Pavel, A., Fortino, V., del Giudice, G., Alenius, H., Fyhrquist, N. & Greco, D., tammik. 2024, julkaisussa: Journal of Translational Medicine. 22, 13 Sivumäärä, 64.Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto5 Lataukset (Pure) -
2023
An ancestral molecular response to nanomaterial particulates
del Giudice, G., Serra, A., Saarimäki, L. A., Kotsis, K., Rouse, I., Colibaba, S. A., Jagiello, K., Mikolajczyk, A., Fratello, M., Papadiamantis, A. G., Sanabria, N., Annala, M. E., Morikka, J., Kinaret, P. A. S., Voyiatzis, E., Melagraki, G., Afantitis, A., Tämm, K., Puzyn, T. & Gulumian, M. & 4 muuta, , 2023, julkaisussa: Nature Nanotechnology. 18, 8, s. 957-966 10 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto14 Sitaatiot (Scopus)9 Lataukset (Pure) -
DREAM: an R package for druggability evaluation of human complex diseases
Federico, A., Fratello, M., Pavel, A., Möbus, L., Del Giudice, G., Serra, A. & Greco, D., heinäk. 2023, julkaisussa: Bioinformatics. 39, 7, 4 Sivumäärä, btad442.Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto6 Lataukset (Pure) -
ESPERANTO: a GLP-field sEmi-SuPERvised toxicogenomics metadAta curatioN TOol
Di Lieto, E., Serra, A., Inkala, S. I., Saarimäki, L. A., Del Giudice, G., Fratello, M., Hautanen, V., Annala, M., Federico, A. & Greco, D., kesäk. 2023, julkaisussa: Bioinformatics (Oxford, England). 39, 6, 3 Sivumäärä, btad405.Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto4 Lataukset (Pure) -
KNeMAP: A network mapping approach for knowledge-driven comparison of transcriptomic profiles
Pavel, A., Del Giudice, G., Fratello, M., Ghemtio, L., Di Lieto, A., Yli-Kauhaluoma, J., Xhaard, H., Federico, A., Serra, A. & Greco, D., toukok. 2023, julkaisussa: Bioinformatics. 39, 6, 8 Sivumäärä, btad341.Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto5 Lataukset (Pure) -
OxLDL sensitizes platelets for increased formation of extracellular vesicles capable of finetuning macrophage gene expression
Maaninka, K., Neuvonen, M., Kerkelä, E., Hyvärinen, K., Palviainen, M., Kamali-Moghaddam, M., Federico, A., Greco, D., Laitinen, S., Öörni, K. & Siljander, P. R., kesäk. 2023, julkaisussa: EUROPEAN JOURNAL OF CELL BIOLOGY. 102, 2, 15 Sivumäärä, 151311.Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto4 Sitaatiot (Scopus)3 Lataukset (Pure) -
Targeting metabolism by B-raf inhibitors and diclofenac restrains the viability of BRAF-mutated thyroid carcinomas with Hif-1α-mediated glycolytic phenotype
Aprile, M., Cataldi, S., Perfetto, C., Federico, A., Ciccodicola, A. & Costa, V., 10 elok. 2023, julkaisussa: British Journal of Cancer. 129, 2, s. 249-265 17 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto7 Sitaatiot (Scopus)18 Lataukset (Pure) -
Toxicogenomics Data for Chemical Safety Assessment and Development of New Approach Methodologies: An Adverse Outcome Pathway-Based Approach
Saarimäki, L. A., Morikka, J., Pavel, A., Korpilähde, S., del Giudice, G., Federico, A., Fratello, M., Serra, A. & Greco, D., 13 tammik. 2023, julkaisussa: Advanced science. 10, 2, 2203984.Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto12 Sitaatiot (Scopus)18 Lataukset (Pure) -
2022
Computationally prioritized drugs inhibit SARS-CoV-2 infection and syncytia formation
Serra, A., Fratello, M., Federico, A., Ojha, R., Provenzani, R., Tasnadi, E., Cattelani, L., Del Giudice, G., Kinaret, P. A. S., Saarimäki, L. A., Pavel, A., Kuivanen, S., Cerullo, V., Vapalahti, O., Horvath, P., Lieto, A. D., Yli-Kauhaluoma, J., Balistreri, G. & Greco, D., tammik. 2022, julkaisussa: Briefings in Bioinformatics. 23, 1, 20 Sivumäärä, bbab507.Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto15 Sitaatiot (Scopus)30 Lataukset (Pure) -
Integrated Network Pharmacology Approach for Drug Combination Discovery: A Multi‐Cancer Case Study
Federico, A., Fratello, M., Scala, G., Möbus, L., Pavel, A., Del Giudice, G., Ceccarelli, M., Costa, V., Ciccodicola, A., Fortino, V., Serra, A. & Greco, D., huhtik. 2022, julkaisussa: Cancers. 14, 8, 16 Sivumäärä, 2043.Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto12 Sitaatiot (Scopus)49 Lataukset (Pure) -
Nextcast: A software suite to analyse and model toxicogenomics data
Serra, A., Saarimäki, L. A., Pavel, A., del Giudice, G., Fratello, M., Cattelani, L., Federico, A., Laurino, O., Marwah, V. S., Fortino, V., Scala, G., Kinaret, P. A. S. & Greco, D., tammik. 2022, julkaisussa: Computational and structural biotechnology journal. 20, s. 1413-1426Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto5 Sitaatiot (Scopus)8 Lataukset (Pure) -
The integration of large-scale public data and network analysis uncovers molecular characteristics of psoriasis
Federico, A., Pavel, A., Möbus, L., McKean, D., del Giudice, G., Fortino, V., Niehues, H., Rastrick, J., Eyerich, K., Eyerich, S., van den Bogaard, E., Smith, C., Weidinger, S., de Rinaldis, E. & Greco, D., jouluk. 2022, julkaisussa: Human Genomics. 16, 1, 62.Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto3 Sitaatiot (Scopus)42 Lataukset (Pure) -
The potential of a data centred approach & knowledge graph data representation in chemical safety and drug design
Pavel, A., Saarimäki, L. A., Möbus, L., Federico, A., Serra, A. & Greco, D., 2022, julkaisussa: Computational and structural biotechnology journal. 20, s. 4837-4849 13 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto5 Sitaatiot (Scopus)15 Lataukset (Pure) -
2021
A systematic comparison of data- and knowledge-driven approaches to disease subtype discovery
Rintala, T. J., Federico, A., Latonen, L., Greco, D. & Fortino, V., 2021, julkaisussa: Briefings in Bioinformatics. 22, 6, bbab314.Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto3 Sitaatiot (Scopus)5 Lataukset (Pure) -
CpGmotifs: a tool to discover DNA motifs associated to CpG methylation events
Scala, G., Federico, A. & Greco, D., toukok. 2021, julkaisussa: BMC Bioinformatics. 22, 278.Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto1 Sitaatiot (Scopus)9 Lataukset (Pure) -
Integrated network analysis reveals new genes suggesting COVID-19 chronic effects and treatment
Pavel, A., Del Giudice, G., Federico, A., Di Lieto, A., Kinaret, P. A. S., Serra, A. & Greco, D., 2021, julkaisussa: Briefings in Bioinformatics. 22, 2, s. 1430-1441 12 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto27 Sitaatiot (Scopus)7 Lataukset (Pure) -
Multi-walled carbon nanotubes elicit concordant changes in DNA methylation and gene expression following long-term pulmonary exposure in mice
Scala, G., Delaval, M. N., Mukherjee, S. P., Federico, A., Khaliullin, T. O., Yanamala, N., Fatkhutdinova, L. M., Kisin, E. R., Greco, D., Fadeel, B. & Shvedova, A. A., 30 kesäk. 2021, julkaisussa: Carbon. 178, s. 563-572 10 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto9 Sitaatiot (Scopus)10 Lataukset (Pure) -
PeptiCHIP: A Microfluidic Platform for Tumor Antigen Landscape Identification
Feola, S., Haapala, M., Peltonen, K., Capasso, C., Martins, B., Antignani, G., Federico, A., Pietiäinen, V., Chiaro, J., Feodoroff, M., Russo, S., Rannikko, A., Fusciello, M., Koskela, S., Partanen, J., Hamdan, F., Tähkä, S. M., Ylösmäki, E., Greco, D. & Grönholm, M. & 8 muuta, , 2021, julkaisussa: ACS Nano. 15, 10, s. 15992–16010Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto18 Sitaatiot (Scopus)16 Lataukset (Pure) -
VOLTA: adVanced mOLecular neTwork Analysis
Pavel, A., Federico, A., del Giudice, G., Serra, A. & Greco, D., 2021, julkaisussa: Bioinformatics. 37, 23, 4587-4588.Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto6 Sitaatiot (Scopus)7 Lataukset (Pure) -
2020
Carbon Nanomaterials Promote M1/M2 Macrophage Activation
Scala, G., Federico, A., Sund, J. & Greco, D., 2020, julkaisussa: Small. 16, 21, 1907609.Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
39 Sitaatiot (Scopus) -
DNA sequence context as a marker of CpG methylation instability in normal and cancer tissues
Scala, G., Federico, A., Palumbo, D., Cocozza, S. & Greco, D., 2020, julkaisussa: Scientific Reports. 10, 1, 1721.Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
14 Sitaatiot (Scopus) -
Manually curated and harmonised transcriptomics datasets of psoriasis and atopic dermatitis patients
Federico, A., Hautanen, V., Christian, N., Kremer, A., Serra, A. & Greco, D., 2020, julkaisussa: Scientific Data. 7, 1, 343.Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto8 Sitaatiot (Scopus)17 Lataukset (Pure) -
TinderMIX: Time-dose integrated modelling of toxicogenomics data
Serra, A., Fratello, M., Del Giudice, G., Saarimäki, L. A., Paci, M., Federico, A. & Greco, D., 2020, julkaisussa: GigaScience. 9, 5, giaa055.Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto18 Sitaatiot (Scopus)37 Lataukset (Pure) -
Toxicogenomics analysis of dynamic dose-response in macrophages highlights molecular alterations relevant for multi-walled carbon nanotube-induced lung fibrosis
Saarimäki, L. A., Kinaret, P. A. S., Scala, G., del Giudice, G., Federico, A., Serra, A. & Greco, D., lokak. 2020, julkaisussa: NanoImpact. 20, 100274.Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto17 Sitaatiot (Scopus)13 Lataukset (Pure) -
2019
Inhibition of histone demethylases LSD1 and UTX regulates ER? signaling in breast cancer
Benedetti, R., Baldi, A., Niméus, E., Schultz, J., Höglund, U., Maione, S., Papulino, C., Chianese, U., Iovino, F., Federico, A., Mai, A., Dell'aversana, C., Stunnenberg, H. G., Nebbioso, A., Altucci, L., De Marchi, T., Rotili, D., Liu, N. Q., Novakovic, B. & Boccella, S. & 2 muuta, , 2019, julkaisussa: Cancers. 11, 12, 2027.Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
36 Sitaatiot (Scopus)