Emre Kapucu

Tutkimustuotos

Tutkimustuotoksia vuodessa 2008 2009 2015 2016 2022

• 15 Konferenssiartikkeli
• 7 Artikkeli
• 6 Abstrakti
• 1 Väitöskirja
• 3 Lisää
  • 1 Luku
  • 1 Keskustelupuheenvuoro
  • 1 Data-artikkeli

Tutkimustuotoksia vuodessa

Tutkimustuotoksia vuodessa

Hakutulokset

• 2022

  A kainic acid-induced seizure model in human pluripotent stem cell-derived cortical neurons for studying the role of IL-6 in the functional activity

  Mzezewa, R., Lotila, J., Kiiski, H., Vinogradov, A., Kapucu, F. E., Peltola, J., Hagman, S. & Narkilahti, S., huhtik. 2022, julkaisussa: Stem Cell Research. 60, 102665.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

  • Pluripotent Stem Cells 100%
  • Kainic Acid 99%
  • Seizures 66%
  • Interleukin-6 65%
  • Neurons 52%
  15 Lataukset (Pure)

• Comparative microelectrode array data of the functional development of hPSC-derived and rat neuronal networks

  Kapucu, F. E., Vinogradov, A., Hyvärinen, T., Ylä-Outinen, L. & Narkilahti, S., maalisk. 2022, julkaisussa: Scientific Data. 9, 10 Sivumäärä, 120.

  Tutkimustuotos: Data-artikkeli › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

  • Neuronal Network 100%
  • Stem cells 94%
  • Stem Cells 93%
  • Microelectrodes 88%
  • Rats 79%
  1 Lataukset (Pure)
• 2021

  Analyzing unidirectional axonal growth on microfluidic devices

  Kapucu, E., Narkilahti, S., Sukki, L. & Kallio, P., heinäk. 2021.

  Tutkimustuotos: Abstrakti › Scientific

  • Lab-On-A-Chip Devices 100%
  • Growth 36%
  • Neurons 22%
  • Direction compound 21%
  • In Vitro Techniques 12%

• An analysis pipeline for signaling of human stem cell derived neurons in a microfluidics platform with an embedded microelectrode array

  Vinogradov, A., Kapucu, E. & Narkilahti, S., marrask. 2021.

  Tutkimustuotos: Abstrakti › Scientific

  • Microfluidics 100%
  • Microelectrodes 93%
  • Action Potentials 75%
  • Electrodes 71%
  • Cultured Cells 70%

• Directional Growth of Human Neuronal Axons in a Microfluidic Device with Nanotopography on Azobenzene-Based Material

  Ristola, M., Fedele, C., Hagman, S., Sukki, L., Kapucu, F. E., Mzezewa, R., Hyvärinen, T., Kallio, P., Priimagi, A. & Narkilahti, S., 2021, julkaisussa: Advanced Materials Interfaces. 8, 11, 2100048.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

  • Azobenzene 100%
  • Axons 77%
  • Microfluidics 55%
  • Stem cells 29%
  • Neurons 29%
  35 Lataukset (Pure)
• 2020

  Corrigendum: Spectral Entropy Based Neuronal Network Synchronization Analysis Based on Microelectrode Array Measurements (Front. Comput. Neurosci, (2016), 10, (112), 10.3389/fncom.2016.00112)

  Kapucu, F. E., Välkki, I., Mikkonen, J. E., Leone, C., Lenk, K., Tanskanen, J. M. A. & Hyttinen, J. A. K., 4 marrask. 2020, julkaisussa: Frontiers in Computational Neuroscience. 14, 586506.

  Tutkimustuotos: Keskustelupuheenvuoro › Scientific › vertaisarvioitu

  Open access

  • Entropy 100%
  • Microelectrodes 93%
  • Sexually Transmitted Diseases 82%
  • Publications 34%
• 2019

  Advances in Human Stem Cell-Derived Neuronal Cell Culturing and Analysis

  Ylä-Outinen, L., Tanskanen, J. M. A., Hyysalo, A., Hyttinen, J. A. K., Narkilahti, S. & Kapucu, F. E., 2019, In Vitro Neuronal Networks. Chiappalone, M., Pasquale, V. & Frega, M. (toim.). s. 299-329 31 Sivumäärä (Advances in Neurobiology; Vuosikerta 22).

  Tutkimustuotos: Luku › Scientific › vertaisarvioitu

  • Stem Cells 100%
  • Pluripotent Stem Cells 52%
  • Biophysics 31%
  • Entropy 27%
  • Preclinical Drug Evaluations 26%
  1 Sitaatiot (Scopus)

• Functional characterization of human pluripotent stem cell-derived cortical networks differentiated on laminin-521 substrate : comparison to rat cortical cultures

  Hyvärinen, T., Hyysalo, A., Kapucu, F. E., Aarnos, L., Vinogradov, A., Eglen, S. J., Ylä-Outinen, L. & Narkilahti, S., 2019, julkaisussa: Scientific Reports. 9, 1, 17125.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
  13 Sitaatiot (Scopus)
• 2018

  Evaluation of the effective and functional connectivity estimators for microelectrode array recordings during in vitro neuronal network maturation

  Kapucu, E., Tanskanen, J., Christophe, F., Mikkonen, T. & Hyttinen, J., 2018, EMBEC and NBC 2017 - Joint Conference of the European Medical and Biological Engineering Conference EMBEC 2017 and the Nordic-Baltic Conference on Biomedical Engineering and Medical Physics, NBC 2017. Springer Verlag, s. 1105-1108 (IFMBE Proceedings; Vuosikerta 65).

  Tutkimustuotos: Konferenssiartikkeli › Scientific › vertaisarvioitu

  • Entropy 100%
  • Microelectrodes 93%
  • In Vitro Techniques 36%
  • Neurons 25%
  1 Sitaatiot (Scopus)
• 2017

  Network-wide adaptive burst detection depicts neuronal activity with improved accuracy

  Välkki, I. A., Lenk, K., Mikkonen, J. E., Kapucu, F. E. & Hyttinen, J. A. K., 31 toukok. 2017, julkaisussa: Frontiers in Computational Neuroscience. 11, 40.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

  • Statistics 100%
  • Microelectrodes 96%
  • Electrodes 74%
  • Statistical Data Interpretation 53%
  • Psychological Power 40%
  5 Sitaatiot (Scopus)

  17 Lataukset (Pure)

• On electrophysiological signal complexity during biological neuronal network development and maturation

  Kapucu, F. E., Välkki, I., Christophe, F., Tanskanen, J. M. A., Johansson, J., Mikkonen, T. & Hyttinen, J. A. K., 15 heinäk. 2017, 2017 39th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC). IEEE

  Tutkimustuotos: Konferenssiartikkeli › Scientific › vertaisarvioitu

  • Entropy 100%
  • Population 54%
  • Microelectrodes 31%
  • Neurons 17%
  • In Vitro Techniques 12%
  1 Sitaatiot (Scopus)
• 2016

  Analyzing the feasibility of time correlated spectral entropy for the assessment of neuronal synchrony

  Kapucu, F. E., Mikkonen, J. E., Tanskanen, J. M. A. & Hyttinen, J. A. K., 2016, 2016 IEEE 38th Annual International Conference of the Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC). IEEE

  Tutkimustuotos: Konferenssiartikkeli › Scientific › vertaisarvioitu

  • Microelectrodes 100%
  • Entropy 94%
  • Rats 44%
  • Electric network analysis 38%
  4 Sitaatiot (Scopus)

• Automatic Objective Criterion for Setting Neuronal Action Potential Spike Detection Thresholds

  Tanskanen, J., Kapucu, F. E. & Hyttinen, J., 2 heinäk. 2016.

  Tutkimustuotos: Abstrakti › Scientific

  Open access

• Automatic objective thresholding to detect neuronal action potentials

  Tanskanen, J. M. A., Kapucu, F. E., Välkki, I. & Hyttinen, J. A. K., 29 elok. 2016, Proceedings of 2016 24th European Signal Processing Conference (EUSIPCO). s. 662-666 5 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Konferenssiartikkeli › Scientific › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

  • Microelectrodes 100%
  • Mathematical operators 68%
  • Action Potentials 68%
  • Set theory 48%
  2 Sitaatiot (Scopus)

  67 Lataukset (Pure)

• Characterizing Neuronal Network Burst Synchrony by Using Burst Signal

  Välkki, I., Kapucu, F. E., Johansson, J., Lenk, K. & Hyttinen, J., 24 kesäk. 2016.

  Tutkimustuotos: Abstrakti › Scientific

• Methods to Enhance Information Extraction from Microelectrode Array Measurements of Neuronal Networks

  Kapucu, F. E., 30 marrask. 2016, Tampere University of Technology. 82 Sivumäärä (Tampere University of Technology. Publication; Vuosikerta 1438)

  Tutkimustuotos: Väitöskirja › Collection of Articles

  Open access

  Tiedosto

  • Microelectrodes 100%
  • Entropy 36%
  • Stem cells 15%
  • Chemical analysis 13%
  • Assays 12%
  277 Lataukset (Pure)

• Objective Thresholding of MEA Data for Action Potential Detection

  Tanskanen, J., Kapucu, E., Välkki, I., Lenk, K. & Hyttinen, J., 24 kesäk. 2016.

  Tutkimustuotos: Abstrakti › Scientific

• Spectral Entropy Based Neuronal Network Synchronization Analysis Based on Microelectrode Array Measurements

  Kapucu, F. E., Välkki, I., Mikkonen, J. E., Leone, C., Lenk, K., Tanskanen, J. M. A. & Hyttinen, J. A. K., 18 lokak. 2016, julkaisussa: Frontiers in Computational Neuroscience. 10, 112.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

  • Entropy 100%
  • Microelectrodes 93%
  • Data Analysis 14%
  • In Vitro Techniques 11%
  • Cell Culture Techniques 9%
  9 Sitaatiot (Scopus)

  238 Lataukset (Pure)

• The Influence of Structural Changes and Population Interactions on the Entropy Based Synchronicity

  Kapucu, F. E., Vornanen, I., Tanskanen, J., Christophe, F. & Hyttinen, J., 24 kesäk. 2016. 2 Sivumäärä.

  Tutkimustuotos: Abstrakti › Scientific
• 2015

  A fast stimulability screening protocol for neuronal cultures on microelectrode arrays

  Kapucu, F. E., Tanskanen, J. M. A., Yuan, Y. & Hyttinen, J. A. K., 2015, 2015 37th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC). s. 3440-3443 4 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Konferenssiartikkeli › Scientific › vertaisarvioitu

  • Microelectrodes 100%
  • Incubators 29%
  • Brain 21%
  • Electric Stimulation 20%
  2 Lataukset (Pure)

• Joint analysis of extracellular spike waveforms and neuronal network bursts

  Kapucu, F. E., Mäkinen, M. E-L., Tanskanen, J. M. A., Ylä-Outinen, L., Narkilahti, S. & Hyttinen, J. A. K., 2015, julkaisussa: Journal of Neuroscience Methods. 259, s. 143-155

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu

  • Electrodes 100%
  • 6-Cyano-7-nitroquinoxaline-2,3-dione 80%
  • Action Potentials 52%
  • Statistics 44%
  • Stem Cells 42%
  8 Sitaatiot (Scopus)

• On the threshold based neuronal spike detection, and an objective criterion for setting the threshold

  Tanskanen, J. M. A., Kapucu, F. E. & Hyttinen, J. A. K., 1 heinäk. 2015, International IEEE/EMBS Conference on Neural Engineering, NER. s. 1016-1019 4 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Konferenssiartikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
  3 Sitaatiot (Scopus)

• Quantification and automatized adaptive detection of in vivo and in vitro neuronal bursts based on signal complexity

  Kapucu, F. E., Mikkonen, J. E., Tanskanen, J. M. A. & Hyttinen, J. A. K., 2015, 2015 37th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC). s. 4729-4732 4 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Konferenssiartikkeli › Scientific › vertaisarvioitu

  • Entropy 100%
  • Rats 70%
  • Microelectrodes 39%
  • Cell culture 38%
  • Signal analysis 32%
  4 Sitaatiot (Scopus)
• 2012

  Burst analysis methods for analyzing maturing neuronal networks with variable firing statistics

  Julkaisun otsikon käännös: Burst analysis methods for analyzing maturing neuronal networks with variable firing statisticsKapucu, F. E., Tanskanen, J., Mikkonen, J., Ylä-Outinen, L., Narkilahti, S. & Hyttinen, J. A. K., 2012, Conference Proceedings of the 8th International Meeting on Substrate-Integrated Microelectrode Arrays July 10 - July 13, 2012, Reutlingen, Germany. Reutlingen, Germany: NMI Natural and Medical Sciences Institute at the University of Tuebingen, s. 240-241 (International Meeting on Substrate-Integrated Microelectrode Arrays).

  Tutkimustuotos: Konferenssiartikkeli › Scientific › vertaisarvioitu

• Burst analysis tool for developing neuronal networks exhibiting highly varying action potential dynamics

  Kapucu, F. E., Tanskanen, J. M. A., Mikkonen, J. E., Ylä-Outinen, L., Narkilahti, S. & Hyttinen, J. A. K., 2012, julkaisussa: Frontiers in Computational Neuroscience. 6, 38, 14 Sivumäärä, 38.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
  41 Sitaatiot (Scopus)
• 2010

  Tracking the network development of hESC derived neurons during maturation

  Julkaisun otsikon käännös: Tracking the network development of hESC derived neurons during maturationKapucu, F. E., Tanskanen, J. M. A., Mikkonen, J. E., Ylä-Outinen, L., Narkilahti, S. & Hyttinen, J. A. K., 2010, Proceedings of MEA Meeting 2010, the 7th International Meeting on Substrate-Integrated Microelectrode Arrays, Reutlingen, Germany, June 29 - July 2, 2010. s. 94-95

  Tutkimustuotos: Konferenssiartikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
• 2009

  Analysis of spiking activity changes during maturation of hESC derived neurons

  Julkaisun otsikon käännös: Analysis of spiking activity changes during maturation of hESC derived neuronsKapucu, F. E., Ylä-Outinen, L., Heikkilä, T., Mikkonen, J. E., Tanskanen, J. M. A., Narkilahti, S. & Hyttinen, J. A. K., 2009, Proceedings of the 2009 Symposium on Microelectrode Arrays in Tissue Engineering, 4.-5.6.2009, Tampere, Finland. Tanskanen, J. M. A. & Hyttinen, J. A. K. (toim.). s. 12-13

  Tutkimustuotos: Konferenssiartikkeli › Scientific › vertaisarvioitu

• Analyzing human embryonic stemcell –derived cardiomyocytes with microelectrode array platform

  Julkaisun otsikon käännös: Analyzing human embryonic stemcell –derived cardiomyocytes with microelectrode array platformKujala, V., Pekkanen-Mattila, M., Lehtonen, L., Kapucu, F. E., Kerkelä, E., Suuronen, R., Hyttinen, J., Skottman, H. & Aalto-Setälä, K., 2009, International society for stem cell research 7th annual meeting, 8-11 July 2009, Barcelona, Spain.

  Tutkimustuotos: Konferenssiartikkeli › Scientific › vertaisarvioitu

• Analyzing human empryonic stem cell-derived cardiomyocytes with microelectrode array platform

  Julkaisun otsikon käännös: Analyzing human empryonic stem cell-derived cardiomyocytes with microelectrode array platformKujala, V., Pekkanen-Mattila, M., Lehtonen, L., Jimenez, Z. C., Kapucu, F. E., Väisänen, J., Kerkelä, E., Suuronen, R., Hyttinen, J., Skottman, H. & Aalto-Setälä, K., 2009, Proceedings of the 2009 Symposium on Microelectrode Arrays in Tissue Engineering, 4.-5.6.2009, Tampere, Finland. Tanskanen, J. M. A. & Hyttinen, J. A. K. (toim.). s. 14-16

  Tutkimustuotos: Konferenssiartikkeli › Scientific › vertaisarvioitu

• Dynamics of activity during the maturation of neural network derived from human embryonic stem cells

  Julkaisun otsikon käännös: Dynamics of activity during the maturation of neural network derived from human embryonic stem cellsHyttinen, J., Heikkilä, T., Ylä-Outinen, L., Reska, A., Kapucu, E., Mikkonen, J., Tanskanen, J., Suuronen, R., Skottman, H., Schulte, P. & Narkilahti, S., 2009, The European Future Technologies Conference, Science beyond Fiction, 21.-22. April 2009, Prague, Czech Republic. s. 43-44

  Tutkimustuotos: Konferenssiartikkeli › Scientific › vertaisarvioitu
• 2008

  Beating rate variability studies with human embryonic stem cell derived Cardiomyocytes

  Julkaisun otsikon käännös: Beating rate variability studies with human embryonic stem cell derived CardiomyocytesKapucu, F. E., Pekkanen-Mattila, M., Kujala, V., Viik, J., Aalto-Setälä, K., Kerkelä, E., Tanskanen, J. M. A. & Hyttinen, J., 2008, 4th European Conference of the International Federation for Medical and Biological Engineering, 23-27 November 2008, Antwerp, Belgium. IFMBE Proceedings. Vander Sloten, J. (toim.). s. 8-11

  Tutkimustuotos: Konferenssiartikkeli › Scientific › vertaisarvioitu

  2 Sitaatiot (Scopus)

• Phase coupling in EEG burst suppression during propofol anasthesia

  Julkaisun otsikon käännös: Phase coupling in EEG burst suppression during propofol anasthesiaKapucu, F. E., Lipping, T., Jäntti, V. & Huotari, A-M., 2008, Proceedings of the 14th Nordic-Baltic Conference on Biomedical Engineering and Medical Physics, Riga, Latvia, 16.-20.06.2008. Katashev, A., Dekhtyar, Y. & Spigulis, J. (toim.). Berli Heidelberg: Springer Verlag, s. 260-263

  Tutkimustuotos: Konferenssiartikkeli › Scientific › vertaisarvioitu