Tutkimustuotoksia vuodessa
Tutkimustuotoksia vuodessa
Hakutulokset
-
2024
A library of reporters of the global regulators of gene expression in Escherichia coli
Dash, S., Jagadeesan, R., Baptista, I. S. C., Chauhan, V., Kandavalli, V., Oliveira, S. M. D. & Ribeiro, A. S., kesäk. 2024, julkaisussa: mSystems. 9, 6Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto7 Lataukset (Pure) -
Sources of Variability in Gene Expression of Escherichia coli
Calado Baptista, I., 2024, Tampere: Tampere University. (Tampere University Dissertations - Tampereen yliopiston väitöskirjat; Vuosikerta 1094)Tutkimustuotos: Väitöskirja › Collection of Articles
Open access -
Transcription Attenuation in Synthetic Promoters in Nonoverlapping Tandem Formation
Chauhan, V., Baptista, I. S. C., Arsh, A. M., Jagadeesan, R., Dash, S. & Ribeiro, A. S., elok. 2024, julkaisussa: Biochemistry. 63, s. 2009-2022Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto6 Lataukset (Pure) -
2022
Alteration of DNA supercoiling serves as a trigger of short-term cold shock repressed genes of E. coli
Dash, S., Palma, C. S. D., Baptista, I. S. C., Almeida, B. L. B., Bahrudeen, M. N. M., Chauhan, V., Jagadeesan, R. & Ribeiro, A., elok. 2022, julkaisussa: Nucleic Acids Research. 50, 15, s. 8512–8528 17 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto3 Sitaatiot (Scopus)3 Lataukset (Pure) -
Analytical kinetic model of native tandem promoters in E. coli
Chauhan, V., Bahrudeen, M. N. M., Palma, C. S. D., Baptista, I. S. C., Almeida, B. L. B., Dash, S., Kandavalli, V. & Ribeiro, A. S., 31 tammik. 2022, julkaisussa: PLoS Computational Biology. 18, 1, 23 Sivumäärä, e1009824.Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto8 Sitaatiot (Scopus)21 Lataukset (Pure) -
Sequence-dependent model of genes with dual σ factor preference
Baptista, I. S. C., Kandavalli, V., Chauhan, V., Bahrudeen, M. N. M., Almeida, B. L. B., Palma, C. S. D., Dash, S. & Ribeiro, A. S., huhtik. 2022, julkaisussa: Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms. 1865, 3, 194812.Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto6 Sitaatiot (Scopus)7 Lataukset (Pure) -
The transcription factor network of E. coli steers global responses to shifts in RNAP concentration
Almeida, B. L. B., Bahrudeen, M. N. M., Chauhan, V., Dash, S., Kandavalli, V., Häkkinen, A., Lloyd-Price, J., Cristina, P. S. D., Baptista, I. S. C., Gupta, A., Kesseli, J., Dufour, E., Smolander, O.-P., Nykter, M., Auvinen, P., Jacobs, H. T., Oliveira, S. M. D. & Sanches Ribeiro, A., 8 heinäk. 2022, julkaisussa: Nucleic Acids Research. 50, 12, s. 6801-6819 19 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto3 Sitaatiot (Scopus)9 Lataukset (Pure) -
2020
Efficiency and Robustness of Processes Driven by Nucleoid Exclusion in Escherichia coli
Baptista, I., Chauhan, V., Almeida, B., Kandavalli, V. & Ribeiro, A. S., 2020, Physical Microbiology. Duménil, G. & van Teeffelen, S. (toim.). Springer, s. 59-80 22 Sivumäärä (Advances in Experimental Medicine and Biology; Vuosikerta 1267).Tutkimustuotos: Luku › Tieteellinen › vertaisarvioitu
1 Sitaatiot (Scopus) -
Regulatory mechanisms of the dynamics of closely spaced promoters in E. coli
Santos Dias Palma, C., Mohamed Bahrudeen, M., Chauhan, V., Calado Baptista, I., Dash, S., Lima de Brito Almeida, B. & Sanches Ribeiro, A., 2020. 6 Sivumäärä.Tutkimustuotos: Abstrakti › Tieteellinen
Open access -
Single cell, over-time protein numbers of cold shock repressed genes in Escherichia coli
Dash, S., Santos Dias Palma, C., Calado Baptista, I. & Sanches Ribeiro, A., 16 marrask. 2020.Tutkimustuotos: Posteri › Tieteellinen
Open access -
Stochastic models coupling gene expression and partitioning in cell division in Escherichia coli
Calado Baptista, I. & Sanches Ribeiro, A., 2020, julkaisussa: Biosystems. 193, 104154.Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
8 Sitaatiot (Scopus) -
2019
Efficiency and Robustness to Nonoptimal Temperatures of Nucleoid Exclusion Processes in Escherichia coli
Calado Baptista, I., Lima de Brito Almeida, B. & Sanches Ribeiro, A., 2019.Tutkimustuotos: Abstrakti › Tieteellinen
-
Genome-wide responses of Escherichia coli to changing RNA polymerase concentrations
Lima de Brito Almeida, B., Calado Baptista, I., Santos Dias Palma, C., Kandavalli, V., Mohamed Bahrudeen, M., Chauhan, V., Dash, S. & Sanches Ribeiro, A., jouluk. 2019.Tutkimustuotos: Abstrakti › Tieteellinen