Tutkimustuotoksia vuodessa
Tutkimustuotoksia vuodessa
Hakutulokset
-
2025
Unsupervised clustering reveals noncanonical myeloid cell subsets in the brain tumor microenvironment
Hermelo, I., Virtanen, T., Salonen, I., Nätkin, R., Keitaanniemi, S., Tiihonen, A. M., Lehtipuro, S., Kummola, L., Raulamo, E., Nordfors, K., Haapasalo, H., Rauhala, M., Kesseli, J., Nykter, M., Haapasalo, J. & Rautajoki, K., 3 tammik. 2025, julkaisussa: Cancer Immunology, Immunotherapy. 74, 2, 63.Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto10 Lataukset (Pure) -
2024
Aberrant DNA methylation distorts developmental trajectories in atypical teratoid/rhabdoid tumors
Pekkarinen, M., Nordfors, K., Uusi-Mäkelä, J., Kytölä, V., Hartewig, A., Huhtala, L., Rauhala, M., Urhonen, H., Häyrynen, S., Afyounian, E., Yli-Harja, O., Zhang, W., Helen, P., Lohi, O., Haapasalo, H., Haapasalo, J., Nykter, M., Kesseli, J. & Rautajoki, K. J., 2024, julkaisussa: Life science alliance. 7, 6, 18 Sivumäärä, e202302088.Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto1 Sitaatiot (Scopus)24 Lataukset (Pure) -
Motor dysfunction as a primary symptom predicts poor outcome: multicenter study of glioma symptoms
Kivioja, T., Posti, J. P., Sipilä, J., Rauhala, M., Frantzén, J., Gardberg, M., Rahi, M., Rautajoki, K., Nykter, M., Vuorinen, V., Nordfors, K., Haapasalo, H. & Haapasalo, J., 2024, julkaisussa: Frontiers in Oncology. 13, 1305725.Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto1 Sitaatiot (Scopus)13 Lataukset (Pure) -
Previously reported CCDC26 risk variant and novel germline variants in GALNT13, AR, and MYO10 associated with familial glioma in Finland
Nurminen, R., Afyounian, E., Paunu, N., Katainen, R., Isomäki, M., Nurminen, A., Scaravilli, M., Tolppanen, J., Fey, V., Kivinen, A., Helén, P., Välimäki, N., Kesseli, J., Aaltonen, L. A., Haapasalo, H., Nykter, M. & Rautajoki, K. J., 2024, julkaisussa: Scientific Reports. 14, 1, 11562.Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto9 Lataukset (Pure) -
Protumoral lipid droplet-loaded macrophages are enriched in human glioblastoma and can be therapeutically targeted
Governa, V., de Oliveira, K. G., Bång-Rudenstam, A., Offer, S., Cerezo-Magaña, M., Li, J., Beyer, S., Johansson, M. C., Månsson, A. S., Edvardsson, C., Durmo, F., Gustafsson, E., Boukredine, A., Jeannot, P., Schmidt, K., Gezelius, E., Menard, J. A., Garza, R., Jakobsson, J. & de Neergaard, T. & 11 muuta, , 30 lokak. 2024, julkaisussa: SCIENCE TRANSLATIONAL MEDICINE. 16, 771, s. eadk1168Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
2 Sitaatiot (Scopus) -
Single cell and spatial transcriptomics highlight the interaction of club-like cells with immunosuppressive myeloid cells in prostate cancer
Kiviaho, A., Eerola, S. K., Kallio, H. M. L., Andersen, M. K., Hoikka, M., Tiihonen, A. M., Salonen, I., Spotbeen, X., Giesen, A., Parker, C. T. A., Taavitsainen, S., Hantula, O., Marttinen, M., Hermelo, I., Ismail, M., Midtbust, E., Wess, M., Devlies, W., Sharma, A. & Krossa, S. & 27 muuta, , marrask. 2024, julkaisussa: Nature Communications. 15, 1, 9949.Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto2 Sitaatiot (Scopus)6 Lataukset (Pure) -
2023
Distinct transcriptomic profiles in children prior to the appearance of type 1 diabetes-linked islet autoantibodies and following enterovirus infection
Lin, J., Moradi, E., Salenius, K., Lehtipuro, S., Häkkinen, T., Laiho, J. E., Oikarinen, S., Randelin, S., Parikh, H. M., Krischer, J. P., Toppari, J., Lernmark, Å., Petrosino, J. F., Ajami, N. J., She, J.-X., Hagopian, W. A., Rewers, M. J., Lloyd, R. E., Rautajoki, K. J. & Hyöty, H. & 2 muuta, , 22 marrask. 2023, julkaisussa: Nature Communications. 14, 1, 13 Sivumäärä, 7630.Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto8 Sitaatiot (Scopus)23 Lataukset (Pure) -
Early-onset grade 2-3 diffuse gliomas and schwannomas increase the risk of central nervous system tumors among the patients' relatives
Alanen, E., Heikkinen, S., Nurminen, R., Nykter, M., Haapasalo, H., Hirvonen, E., Pitkäniemi, J. & Rautajoki, K. J., helmik. 2023, julkaisussa: Neuro-Oncology Advances. 5, 1, 10 Sivumäärä, vdad008.Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto2 Sitaatiot (Scopus)179 Lataukset (Pure) -
Genomic characterization of IDH-mutant astrocytoma progression to grade 4 in the treatment setting
Rautajoki, K. J., Jaatinen, S., Hartewig, A., Tiihonen, A. M., Annala, M., Salonen, I., Valkonen, M., Simola, V., Vuorinen, E. M., Kivinen, A., Rauhala, M. J., Nurminen, R., Maass, K. K., Lahtela, S. L., Jukkola, A., Yli-Harja, O., Helén, P., Pajtler, K. W., Ruusuvuori, P. & Haapasalo, J. & 3 muuta, , marrask. 2023, julkaisussa: Acta Neuropathologica Communications. 11, 1, 20 Sivumäärä, 176.Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto6 Sitaatiot (Scopus)19 Lataukset (Pure) -
2022
PTPRD and CNTNAP2 as markers of tumor aggressiveness in oligodendrogliomas
Rautajoki, K. J., Jaatinen, S., Tiihonen, A. M., Annala, M., Vuorinen, E. M., Kivinen, A., Rauhala, M. J., Maass, K. K., Pajtler, K. W., Yli-Harja, O., Helén, P., Haapasalo, J., Haapasalo, H., Zhang, W. & Nykter, M., 18 elok. 2022, julkaisussa: Scientific Reports. 12, 14083.Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto9 Sitaatiot (Scopus)21 Lataukset (Pure) -
2021
CD109-GP130 interaction drives glioblastoma stem cell plasticity and chemoresistance through STAT3 activity
Filppu, P., Ramanathan, J. T., Granberg, K. J., Gucciardo, E., Haapasalo, H., Lehti, K., Nykter, M., Le Joncour, V. & Laakkonen, P., 10 toukok. 2021, julkaisussa: Jci Insight. 6, 9, e141486.Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto30 Sitaatiot (Scopus)15 Lataukset (Pure) -
Genetic and Epigenetic Characteristics of Inflammatory Bowel Disease–Associated Colorectal Cancer
Rajamäki, K., Taira, A., Katainen, R., Välimäki, N., Kuosmanen, A., Plaketti, R. M., Seppälä, T. T., Ahtiainen, M., Wirta, E. V., Vartiainen, E., Sulo, P., Ravantti, J., Lehtipuro, S., Granberg, K. J., Nykter, M., Tanskanen, T., Ristimäki, A., Koskensalo, S., Renkonen-Sinisalo, L. & Lepistö, A. & 6 muuta, , 2021, julkaisussa: Gastroenterology. 161, 2, s. 592-607Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto131 Sitaatiot (Scopus)12 Lataukset (Pure) -
Single-cell ATAC and RNA sequencing reveal pre-existing and persistent cells associated with prostate cancer relapse
Taavitsainen, S., Engedal, N., Cao, S., Handle, F., Erickson, A., Prekovic, S., Wetterskog, D., Tolonen, T., Vuorinen, E. M., Kiviaho, A., Nätkin, R., Häkkinen, T., Devlies, W., Henttinen, S., Kaarijärvi, R., Lahnalampi, M., Kaljunen, H., Nowakowska, K., Syvälä, H. & Bläuer, M. & 13 muuta, , 2021, julkaisussa: Nature Communications. 12, 1, 5307.Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto75 Sitaatiot (Scopus)57 Lataukset (Pure) -
2020
Glioblastoma Multiforme Stem Cell Cycle Arrest by Alkylaminophenol Through the Modulation of EGFR and CSC Signaling Pathways
Doan, P., Musa, A., Murugesan, A., Sipilä, V., Candeias, N. R., Emmert-Streib, F., Ruusuvuori, P., Granberg, K., Yli-Harja, O. & Kandhavelu, M., 2020, julkaisussa: Cells. 9, 3, 21 Sivumäärä, 681.Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto24 Sitaatiot (Scopus)38 Lataukset (Pure) -
Immunogenomic Landscape of Hematological Malignancies
Dufva, O., Pölönen, P., Brück, O., Granberg, K., Nykter, M. & Lohi, O., 2020, julkaisussa: Cancer Cell. 38, 3, s. 380-399.e13Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
112 Sitaatiot (Scopus) -
Moderate-to-strong expression of FGFR3 and TP53 alterations in a subpopulation of choroid plexus tumors
Granberg, K., Raita, A., Lehtinen, B., Tiihonen, A., Kesseli, J., Annala, M., Rodriguez Martinez, A., Nordfors, K., Zhang, W., Visakorpi, T., Nykter, M. & Haapasalo, H., 2020, julkaisussa: Histology and Histopathology. 35, 7, s. 673-680Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
2 Sitaatiot (Scopus) -
2019
Data-driven characterization of molecular phenotypes across heterogeneous sample collections
Mehtonen, J., Pölönen, P., Häyrynen, S., Dufva, O., Lin, J., Liuksiala, T., Granberg, K., Lohi, O., Hautamäki, V., Nykter, M. & Heinäniemi, M., 2019, julkaisussa: Nucleic Acids Research. 47, 13, s. e76 e76.Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
16 Sitaatiot (Scopus) -
Hemap: An Interactive Online Resource for Characterizing Molecular Phenotypes across Hematologic Malignancies
Pölönen, P., Mehtonen, J., Lin, J., Liuksiala, T., Häyrynen, S., Teppo, S., Mäkinen, A., Kumar, A., Malani, D., Pohjolainen, V., Porkka, K., Heckman, C. A., May, P., Hautamäki, V., Granberg, K. J., Lohi, O., Nykter, M. & Heinäniemi, M., 2019, julkaisussa: Cancer Research. 79, 10, s. 2466-2479Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
19 Sitaatiot (Scopus) -
2018
Computational characterization of suppressive immune microenvironments in glioblastoma
Luoto, S., Hermelo, I., Vuorinen, E., Hannus, P., Kesseli, J., Nykter, M., Granberg, K., Hermelo, A. I. & Lehtipuro, S., 2018, julkaisussa: Cancer Research. 78, 19, s. 5574-5585Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
54 Sitaatiot (Scopus) -
NRF2, DJ1 and SNRX1 and their prognostic impact in astrocytic gliomas
Haapasalo, J., Nordfors, K., Granberg, K., Kivioja, T., Nykter, M., Haapasalo, H. & Soini, Y., 2018, julkaisussa: Histology and Histopathology. 33, 8, s. 791-801Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
18 Sitaatiot (Scopus) -
Whole-exome sequencing identifies germline mutation in TP53 and ATRX in a child with genomically aberrant AT/RT and her mother with anaplastic astrocytoma
Nordfors, K., Haapasalo, J., Ebrahim, A., Afyounian, E., Tuominen, J., Annala, M., Häyrynen, S., Karhu, R., Helén, P., Lohi, O., Nykter, M., Haapasalo, H. & Granberg, K. J., maalisk. 2018, julkaisussa: Cold Spring Harbor Molecular Case Studies. 4, 2, 13 Sivumäärä, a002246.Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open access6 Sitaatiot (Scopus) -
2017
Clinical association analysis of ependymomas and pilocytic astrocytomas reveals elevated FGFR3 and FGFR1 expression in aggressive ependymomas
Lehtinen, B., Raita, A., Kesseli, J., Annala, M., Nordfors, K., Yli-Harja, O., Zhang, W., Visakorpi, T., Nykter, M., Haapasalo, H. & Granberg, K. J., 2017, julkaisussa: BMC Cancer. 17, 1, s. 310 310.Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto21 Sitaatiot (Scopus)71 Lataukset (Pure) -
Strong FGFR3 staining is a marker for FGFR3 fusions in diffuse gliomas
Granberg, K., Annala, M., Lehtinen, B., Kesseli, J., Haapasalo, J., Ruusuvuori, P., Yli-Harja, O., Visakorpi, T., Haapasalo, H., Nykter, M. & Zhang, W., 2017, julkaisussa: Neuro-Oncology. 19, 9, s. 1206-1216 11 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
30 Sitaatiot (Scopus) -
2015
Genomically amplified Akt3 activates DNA repair pathway and promotes glioma progression
Turner, K. M., Sun, Y., Granberg, K. J., Bernard, B., Hu, L., Cogdell, D. E., Zhou, X., Yli-Harja, O., Nykter, M., Shmulevich, I., Yung, W., Fuller, G. N. & Zhang, W., 2015, julkaisussa: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 112, 11, s. 3421-3426 6 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
92 Sitaatiot (Scopus) -
IGFBP2 potentiates nuclear EGFR-STAT3 signaling
Chua, C., Liu, Y., Granberg, K. J., Hu, L., Haapasalo, H., Annala, M. J., Cogdell, D. E., Verploegen, M., Moore, L. M., Fuller, G. N., Nykter, M., Cavenee, W. K. & Zhang, W., 2015, julkaisussa: Oncogene. 35, 6, s. 738-747Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
70 Sitaatiot (Scopus) -
Recurrent SKIL-activating rearrangements in ETS-negative prostate cancer
Annala, M., Kivinummi, K., Tuominen, J., Karakurt, S., Granberg, K., Latonen, L., Ylipää, A., Sjöblom, L., Ruusuvuori, P., Saramäki, O., Kaukoniemi, K. M., Yli-Harja, O., Vessella, R. L., Tammela, T. L. J., Zhang, W., Visakorpi, T. & Nykter, M., 2015, julkaisussa: Oncotarget. 6, 8, s. 6235-6250 16 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
24 Sitaatiot (Scopus) -
Twist predicts poor outcome of patients with astrocytic glioma
Nordfors, K., Haapasalo, J., Mäkelä, K., Granberg, K. J., Nykter, M., Korja, M., Paavonen, T., Haapasalo, H. & Soini, Y., 2015, julkaisussa: Journal of Clinical Pathology. 68, 11, s. 905-912 8 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
22 Sitaatiot (Scopus) -
Two mature products of MIR-491 coordinate to suppress key cancer hallmarks in glioblastoma
Li, X., Liu, Y., Granberg, K. J., Wang, Q., Moore, L. M., Ji, P., Gumin, J., Sulman, E., Calin, G. A., Haapasalo, H., Nykter, M., Shmulevich, I., Fuller, G., Lang, F. F. & Zhang, W., 2015, julkaisussa: Oncogene. 34, 13, s. 1619-28 10 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
84 Sitaatiot (Scopus) -
2014
Overexpression of SNORD114-3 marks acute promyelocytic leukemia
Liuksiala, T., Teittinen, K. J., Granberg, K., Heinäniemi, M., Annala, M., Mäki, M., Nykter, M. & Lohi, O., 2014, julkaisussa: Leukemia. 28, 1, s. 233-236 3 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen
19 Sitaatiot (Scopus) -
2013
ESTOOLS Data@Hand: human stem cell gene expression resource
Kong, L., Aho, K.-L., Granberg, K., Lund, R., Järvenpää, L., Seppälä, J., Gokhale, P., Leinonen, K., Hahne, L., Mäkelä, J., Laurila, K., Pukkila, H., Närvä, E., Yli-Harja, O., Andrews, P. W., Nykter, M., Lahesmaa, R., Roos, C. & Autio, R., 2013, julkaisussa: Nature Methods. 10, 9, s. 814-815 2 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen
5 Sitaatiot (Scopus) -
Sorad: A systems biology approach to predict and modulate dynamic signaling pathway response from phosphoproteome time-course measurements
Julkaisun otsikon käännös :Sorad: A systems biology approach to predict and modulate dynamic signaling pathway response from phosphoproteome time-course measurements Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
10 Sitaatiot (Scopus) -
The tumorigenic FGFR3-TACC3 gene fusion escapes miR-99a regulation in glioblastoma
Parker, C., Annala, M., Cogdell, D., Granberg, K., Sun, Y., Ping, J., Li, X., Xia, L., Gumin, J., Zheng, H., Hu, L., Yli-Harja, O., Haapasalo, H., Visakorpi, T., Liu, X., Liu, C.-G., Sawaya, R., Fuller, G., Chen, K. & Lang, F. & 2 muuta, , 2013, julkaisussa: Journal of Clinical Investigation. 123, 2, s. 855-65 11 SivumääräTutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
191 Sitaatiot (Scopus) -
2009
Identification of novel Stat6 regulated proteins in IL-4-treated mouse lymphocytes
Julkaisun otsikon käännös :Identification of novel Stat6 regulated proteins in IL-4-treated mouse lymphocytes Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
12 Sitaatiot (Scopus) -
2008
An insight into molecular mechanisms of human T helper cell differentiation
Julkaisun otsikon käännös :An insight into molecular mechanisms of human T helper cell differentiation Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
63 Sitaatiot (Scopus) -
2007
Interleukin-4 inhibits caspase-3 by regulating several proteins in the Fas pathway during initial stages of human T helper 2 cell differentiation
Julkaisun otsikon käännös :Interleukin-4 inhibits caspase-3 by regulating several proteins in the Fas pathway during initial stages of human T helper 2 cell differentiation Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
25 Sitaatiot (Scopus)