Laura Saarimäki

2025

CompSafeNano project: NanoInformatics approaches for safe-by-design nanomaterials

Zouraris, D., Mavrogiorgis, A., Tsoumanis, A., Saarimäki, L. A., del Giudice, G., Federico, A., Serra, A., Greco, D., Rouse, I., Subbotina, J., Lobaskin, V., Jagiello, K., Ciura, K., Judzinska, B., Mikolajczyk, A., Sosnowska, A., Puzyn, T., Gulumian, M., Wepener, V. & Martinez, D. S. T. & 29 muuta, Petry, R., El Yamani, N., Rundén-Pran, E., Murugadoss, S., Shaposhnikov, S., Minadakis, V., Tsiros, P., Sarimveis, H., Longhin, E. M., SenGupta, T., Olsen, A. K. H., Skakalova, V., Hutar, P., Dusinska, M., Papadiamantis, A. G., Gheorghe, L. C., Reilly, K., Brun, E., Ullah, S., Cambier, S., Serchi, T., Tämm, K., Lorusso, C., Dondero, F., Melagrakis, E., Fraz, M. M., Melagraki, G., Lynch, I. & Afantitis, A., tammik. 2025, julkaisussa: Computational and structural biotechnology journal. 29, s. 13-28 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

2 Sitaatiot (Scopus)

136 Lataukset (Pure)

INSIGHT: An integrated framework for safe and sustainable chemical and material assessment

Serra, A., Zouraris, D., Schaffert, A., Torres Maia, M., Tsiros, P., Virmani, I., Di Lieto, E., Saarimäki, L. A., Morikka, J., Riudavets-Puig, R., Varsou, D. D., Papavasileiou, K. D., Kolokathis, P. D., Mintis, D. G., Tzoupis, H., Tsoumanis, A., Melagraki, G., Arvanitidis, A., Doganis, P. & Minadakis, V. & 35 muuta, Savvas, G., Perello-y-bestard, A., Cucurachi, S., Buljan, M., Nikiforou, F., Karakoltzidis, A., Karakitsios, S., Sarigiannis, D. A., Friedrichs, S., Seitz, C., Gutierrez, T. N., Isigonis, P., Cambier, S., Marvuglia, A., Lindner, G. G., Sergent, J. A., Gheorghe, L. C., Bradford, L. J. A., Park, S. G., Ha, S. M., Gerelkhuu, Z., Yoon, T. H., Petry, R., Martinez, D. S. T., Winkler, D. A., Wick, P., Exner, T. E., Dondero, F., Serchi, T., Peijnenburg, W., Sarimveis, H., Paparella, M., Lynch, I., Afantitis, A. & Greco, D., 2025, julkaisussa: Computational and structural biotechnology journal. 29, s. 125-137 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

1 Sitaatiot (Scopus)

4 Lataukset (Pure)

Nanomaterial grouping: Unraveling the relationship of induced mechanisms and potency at a temporal scale

Torres Maia, M., Fratello, M., del Giudice, G., Saarimäki, L. A., Möbus, L., Serra, A. & Greco, D., huhtik. 2025, julkaisussa: NANO TODAY. 61, 102639.

Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

1 Sitaatiot (Scopus)

8 Lataukset (Pure)

2024

A Network Toxicology Approach for Mechanistic Modelling of Nanomaterial Hazard and Adverse Outcomes

del Giudice, G., Serra, A., Pavel, A., Torres Maia, M., Saarimäki, L. A., Fratello, M., Federico, A., Alenius, H., Fadeel, B. & Greco, D., 27 elok. 2024, julkaisussa: Advanced science. 11, 32, 2400389.

Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

22 Sitaatiot (Scopus)

8 Lataukset (Pure)

Polyphenol- and Glucuronoxylan-Rich Fiber Extract from Birch (Betula sp.) Wood Regulates Colonic Barrier Function and Cell Proliferation in Healthy Rats

Kynkäänniemi, E., Lindén, J., Ngambundit, S., Saarimäki, L. A., Greco, D., Slaba, H., Lahtinen, M. H., Mikkonen, K. S. & Pajari, A. M., 21 helmik. 2024, julkaisussa: Journal of Agricultural and Food Chemistry. 72, 7, s. 3495-3505 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

2 Sitaatiot (Scopus)

1 Lataukset (Pure)

2023

Advancing chemical safety assessment through an omics-based characterization of the test system-chemical interaction

del Giudice, G., Migliaccio, G., D’Alessandro, N., Saarimäki, L. A., Torres Maia, M., Annala, M. E., Leppänen, J., Möbus, L., Pavel, A., Vaani, M., Vallius, A., Ylä-Outinen, L., Greco, D. & Serra, A., 2023, julkaisussa: Frontiers in Toxicology. 5, 7 Sivumäärä, 1294780.

Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

8 Sitaatiot (Scopus)

16 Lataukset (Pure)

An ancestral molecular response to nanomaterial particulates

del Giudice, G., Serra, A., Saarimäki, L. A., Kotsis, K., Rouse, I., Colibaba, S. A., Jagiello, K., Mikolajczyk, A., Fratello, M., Papadiamantis, A. G., Sanabria, N., Annala, M. E., Morikka, J., Kinaret, P. A. S., Voyiatzis, E., Melagraki, G., Afantitis, A., Tämm, K., Puzyn, T. & Gulumian, M. & 4 muuta, Lobaskin, V., Lynch, I., Federico, A. & Greco, D., 2023, julkaisussa: Nature Nanotechnology. 18, 8, s. 957-966 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

24 Sitaatiot (Scopus)

18 Lataukset (Pure)

ESPERANTO: a GLP-field sEmi-SuPERvised toxicogenomics metadAta curatioN TOol

Di Lieto, E., Serra, A., Inkala, S. I., Saarimäki, L. A., Del Giudice, G., Fratello, M., Hautanen, V., Annala, M., Federico, A. & Greco, D., kesäk. 2023, julkaisussa: Bioinformatics (Oxford, England). 39, 6, 3 Sivumäärä, btad405.

Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

3 Sitaatiot (Scopus)

13 Lataukset (Pure)

Expanding adverse outcome pathways towards one health models for nanosafety

Saarimäki, L. A., del Giudice, G. & Greco, D., 2023, julkaisussa: Frontiers in Toxicology. 5, 6 Sivumäärä, 1176745.

Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

5 Sitaatiot (Scopus)

8 Lataukset (Pure)

Identification of a Gene Signature Predicting (Nano)Particle-Induced Adverse Lung Outcome in Rats

Valentino, S. A., Seidel, C., Lorcin, M., Sébillaud, S., Wolff, H., Grossmann, S., Viton, S., Nunge, H., Saarimäki, L. A., Greco, D., Cosnier, F. & Gaté, L., kesäk. 2023, julkaisussa: International Journal of Molecular Sciences. 24, 13, 23 Sivumäärä, 10890.

Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

3 Sitaatiot (Scopus)

14 Lataukset (Pure)

The in vitro immunomodulatory effect of multi-walled carbon nanotubes by multilayer analysis

Hautanen, V., Morikka, J., Saarimäki, L. A., Bisenberger, J., Toimela, T., Serra, A. & Greco, D., heinäk. 2023, julkaisussa: NanoImpact. 31, 100476.

Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

4 Sitaatiot (Scopus)

22 Lataukset (Pure)

Toxicogenomics Data for Chemical Safety Assessment and Development of New Approach Methodologies: An Adverse Outcome Pathway-Based Approach

Saarimäki, L. A., Morikka, J., Pavel, A., Korpilähde, S., del Giudice, G., Federico, A., Fratello, M., Serra, A. & Greco, D., 13 tammik. 2023, julkaisussa: Advanced science. 10, 2, 2203984.

Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

25 Sitaatiot (Scopus)

37 Lataukset (Pure)

Transcriptomic profiling reveals differential cellular response to copper oxide nanoparticles and polystyrene nanoplastics in perfused human placenta

Chortarea, S., Gupta, G., Saarimäki, L. A., Netkueakul, W., Manser, P., Aengenheister, L., Wichser, A., Fortino, V., Wick, P., Greco, D. & Buerki-Thurnherr, T., heinäk. 2023, julkaisussa: Environment International. 177, 108015.

Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

22 Sitaatiot (Scopus)

13 Lataukset (Pure)

2022

Biomarkers of nanomaterials hazard from multi-layer data

Fortino, V., Kinaret, P. A. S., Fratello, M., Serra, A., Saarimäki, L. A., Gallud, A., Gupta, G., Vales, G., Correia, M., Rasool, O., Ytterberg, J., Monopoli, M., Skoog, T., Ritchie, P., Moya, S., Vázquez-Campos, S., Handy, R., Grafström, R., Tran, L. & Zubarev, R. & 11 muuta, Lahesmaa, R., Dawson, K., Loeschner, K., Larsen, E. H., Krombach, F., Norppa, H., Kere, J., Savolainen, K., Alenius, H., Fadeel, B. & Greco, D., heinäk. 2022, julkaisussa: Nature Communications. 13, 10 Sivumäärä, 3798.

Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

27 Sitaatiot (Scopus)

12 Lataukset (Pure)

Characterization of ENM Dynamic Dose-Dependent MOA in Lung with Respect to Immune Cells Infiltration

Serra, A., Del Giudice, G., Kinaret, P. A. S., Saarimäki, L. A., Poulsen, S. S., Fortino, V., Halappanavar, S., Vogel, U. & Greco, D., kesäk. 2022, julkaisussa: Nanomaterials. 12, 12, 16 Sivumäärä, 2031.

Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

8 Sitaatiot (Scopus)

14 Lataukset (Pure)

Computationally prioritized drugs inhibit SARS-CoV-2 infection and syncytia formation

Serra, A., Fratello, M., Federico, A., Ojha, R., Provenzani, R., Tasnadi, E., Cattelani, L., Del Giudice, G., Kinaret, P. A. S., Saarimäki, L. A., Pavel, A., Kuivanen, S., Cerullo, V., Vapalahti, O., Horvath, P., Lieto, A. D., Yli-Kauhaluoma, J., Balistreri, G. & Greco, D., tammik. 2022, julkaisussa: Briefings in Bioinformatics. 23, 1, 20 Sivumäärä, bbab507.

Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

16 Sitaatiot (Scopus)

38 Lataukset (Pure)

Nextcast: A software suite to analyse and model toxicogenomics data

Serra, A., Saarimäki, L. A., Pavel, A., del Giudice, G., Fratello, M., Cattelani, L., Federico, A., Laurino, O., Marwah, V. S., Fortino, V., Scala, G., Kinaret, P. A. S. & Greco, D., tammik. 2022, julkaisussa: Computational and structural biotechnology journal. 20, s. 1413-1426

Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

8 Sitaatiot (Scopus)

13 Lataukset (Pure)

The potential of a data centred approach & knowledge graph data representation in chemical safety and drug design

Pavel, A., Saarimäki, L. A., Möbus, L., Federico, A., Serra, A. & Greco, D., 2022, julkaisussa: Computational and structural biotechnology journal. 20, s. 4837-4849 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto