Olli Yli-Harja

Tutkimustuotos

Tutkimustuotoksia vuodessa 1986 1999 2003 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2025

• 183 Artikkeli
• 175 Konferenssiartikkeli
• 10 Kokoomateos
• 9 Abstrakti
• 17 Lisää
  • 6 Luku
  • 4 Tutkimusraportti
  • 4 Katsausartikkeli
  • 2 Keskustelupuheenvuoro
  • 1 Posteri

Tutkimustuotoksia vuodessa

Tutkimustuotoksia vuodessa

Hakutulokset

• 2017

  Effect of alkylaminophenols on growth inhibition and apoptosis of bone cancer cells

  Doan, P., Nguyen, T., Yli-Harja, O., Candeias, N. R. & Kandhavelu, M., 17 heinäk. 2017, julkaisussa: European Journal of Pharmaceutical Sciences. 107, s. 208–216 9 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  • Apoptosis 100%
  • Alkylaminophenol 100%
  • Growth Inhibition 100%
  • U2OS 100%
  • Bone Cancer Cells 100%
  20 Sitaatiot (Scopus)

• Quantification of Transcriptional Noise at Single Cell Single Molecule Level

  Anufrieva, O., Yli-Harja, O. & Kandhavelu, M., jouluk. 2017, julkaisussa: EC Microbiology. 13, 2, s. 45-54

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Ammatillinen

  Open access

• sgnesR: An R package for simulating gene expression data from an underlying real gene network structure considering delay parameters

  Tripathi, S., Lloyd-Price, J., Ribeiro, A., Yli-Harja, O., Dehmer, M. & Emmert-Streib, F., 4 heinäk. 2017, julkaisussa: BMC Bioinformatics. 18, 1, 325.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

  • Network Structure 100%
  • Gene Network 100%
  • Gene Expression Data 100%
  • Delay Parameter 100%
  • Stochastic Gene Networks 100%
  9 Sitaatiot (Scopus)

  78 Lataukset (Pure)

• Strong FGFR3 staining is a marker for FGFR3 fusions in diffuse gliomas

  Granberg, K., Annala, M., Lehtinen, B., Kesseli, J., Haapasalo, J., Ruusuvuori, P., Yli-Harja, O., Visakorpi, T., Haapasalo, H., Nykter, M. & Zhang, W., 2017, julkaisussa: Neuro-Oncology. 19, 9, s. 1206-1216 11 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  • Fibroblast Growth Factor Receptor 3 (FGFR3) 100%
  • Diffuse Glioma 100%
  • Ganglioglioma 100%
  • Fibroblast Growth Factor Receptor 3 100%
  • Staining Technique 100%
  30 Sitaatiot (Scopus)

• Synthesis of phenol-derivatives and biological screening for anticancer activity

  Karjalainen, A., Doan, P., Sandberg, O., Chandraseelan, J. G., Yli-Harja, O., R. Candeias, N. & Kandhavelu, M., 2017, julkaisussa: Anti-Cancer Agents in Medicinal Chemistry. 17, 12, s. 1710-1720

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  • Mitochondrial Calcium 100%
  • Biological Screening 100%
  • Anticancer Activity 100%
  • Phenol Derivatives 100%
  • Isotopes of Calcium 100%
  19 Sitaatiot (Scopus)
• 2016

  Phase-dependent dynamics of the lac promoter under nutrient stress

  Viswanathan, A., Anufrieva, O., Sala, A., Yli-Harja, O. & Kandhavelu, M., 19 huhtik. 2016, julkaisussa: Research in Microbiology. 167, 6, s. 451-461

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  • Lac Promoter 100%
  • Transcription Dynamics 100%
  • Phase Behavior 100%
  • Starvation Conditions 100%
  • Nutrient Stress 100%
  2 Sitaatiot (Scopus)

• Real-time observation of bacterial gene expression noise

  Anufrieva, O., Sala, A., Yli-Harja, O. & Kandhavelu, M., kesäk. 2016, julkaisussa: Nano Communication Networks. 8, s. 68-75

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  • Bacterial Gene Expression 100%
  • Gene Expression Noise 100%
  • Gene Expression 100%
  • Promoter Region 100%
  • Bacterial Gene 100%
  2 Sitaatiot (Scopus)

• Synthesis and biological screening for cytotoxic activity of N-substituted indolines and morpholines

  Doan, P., Karjalainen, A., Chandraseelan, J. G., Sandberg, O., Yli-Harja, O., Rosholm, T., Franzén, R., R. Candeias, N. & Kandhavelu, M., toukok. 2016, julkaisussa: European Journal of Medicinal Chemistry. 120, s. 296-303

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  • N-substituted 100%
  • Morpholine 100%
  • Biological Screening 100%
  • Cytotoxic Activity 100%
  • Indoline 100%
  52 Sitaatiot (Scopus)

• The need for formally defining "modern medicine" by means of experimental design

  Emmert-Streib, F., Tuomisto, L. & Yli-Harja, O., 20 huhtik. 2016, julkaisussa: Frontiers in Genetics. 7, APR, 60.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
  4 Sitaatiot (Scopus)

  40 Lataukset (Pure)
• 2015

  Antimicrobial activity and molecular analysis of azoderivatives of β-diketones

  Viswanathan, A., Sala, A., Yli-Harja, O. & Kandhavelu, M., 23 tammik. 2015, julkaisussa: European Journal of Pharmaceutical Sciences. 66, s. 83-89 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  • Antimicrobial Activity 100%
  • Molecular Analysis 100%
  • Azo Derivatives 100%
  • Activity Analysis 100%
  • β-diketone 100%
  14 Sitaatiot (Scopus)

• Cancer research in the era of next-generation sequencing and big data calls for intelligent modeling

  Yli-Hietanen, J., Ylipää, A. & Yli-Harja, O., 11 huhtik. 2015, julkaisussa: Chinese Journal of Cancer. 34, 10, 12.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  • Data Call 100%
  • Big Data 100%
  • Cancer Research 100%
  • Next-generation Sequencing Data 100%
  • Intelligent Modeling 100%
  3 Sitaatiot (Scopus)

• Genomically amplified Akt3 activates DNA repair pathway and promotes glioma progression

  Turner, K. M., Sun, Y., Granberg, K. J., Bernard, B., Hu, L., Cogdell, D. E., Zhou, X., Yli-Harja, O., Nykter, M., Shmulevich, I., Yung, W., Fuller, G. N. & Zhang, W., 2015, julkaisussa: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 112, 11, s. 3421-3426 6 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  • Glioma Progression 100%
  • AKT3 100%
  • DNA Repair Pathways 100%
  • DNA Repair 100%
  • Ganglioglioma 100%
  93 Sitaatiot (Scopus)

• Origins of Transcriptional Transition: Balance between Upstream and Downstream Regulatory Gene Sequences

  Sala, A., Shoaib, M., Anufrieva, O., Mutharasu, G., Yli-Harja, O. & Kandhavelu, M., 2015, julkaisussa: mBio. 6, 1, 9 Sivumäärä, e02182-14.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  • Burst Size 100%
  • Gene Sequencing 100%
  • Transition Rates 100%
  • Regulatory Genes 100%
  • Cell Phase 100%
  4 Sitaatiot (Scopus)

• Recurrent SKIL-activating rearrangements in ETS-negative prostate cancer

  Annala, M., Kivinummi, K., Tuominen, J., Karakurt, S., Granberg, K., Latonen, L., Ylipää, A., Sjöblom, L., Ruusuvuori, P., Saramäki, O., Kaukoniemi, K. M., Yli-Harja, O., Vessella, R. L., Tammela, T. L. J., Zhang, W., Visakorpi, T. & Nykter, M., 2015, julkaisussa: Oncotarget. 6, 8, s. 6235-6250 16 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  • Prostate Cancer 100%
  • SKIL 100%
  • Overexpression 33%
  • Promoter Region 25%
  • Oncogene 25%
  24 Sitaatiot (Scopus)

• Single-cell kinetics of a repressilator when implemented in a single-copy plasmid

  Oliveira, S. M. D., Chandraseelan, J. G., Häkkinen, A., Goncalves, N. S. M., Yli-Harja, O., Startceva, S. & S. Ribeiro, A., 1 heinäk. 2015, julkaisussa: Molecular Biosystems. 11, 7, s. 1939-1945 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  • Plasmid 100%
  • Repressilator 100%
  • Cell Kinetics 100%
  • Genetics 100%
  • Dynamics 50%
  3 Sitaatiot (Scopus)

• Sparse logistic regression and polynomial modelling for detection of artificial drainage networks

  Liimatainen, K., Heikkilä, R., Yli-Harja, O., Huttunen, H. & Ruusuvuori, P., 3 huhtik. 2015, julkaisussa: Remote Sensing Letters. 6, 4, s. 311-320 10 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  • Sparse Logistic Regression 100%
  • Mire 100%
  • Logistic Regression Modeling 100%
  • Artificial Drainage Network 100%
  • Polynomial Modeling 100%
  4 Sitaatiot (Scopus)

• Transcription closed and open complex dynamics studies reveal balance between genetic determinants and co-factors

  Sala, A., Shoaib, M., Anufrieva, O., Mutharasu, G., Hoque, R. J., Yli-Harja, O. & Kandhavelu, M., 2015, julkaisussa: Physical Biology. 12, 3, 036003.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  5 Sitaatiot (Scopus)

• Transcriptome sequencing reveals PCAT5 as a Novel ERG-Regulated long Noncoding RNA in prostate cancer

  Ylipää, A., Kivinummi, K., Kohvakka, A., Annala, M., Latonen, L., Scaravilli, M., Kartasalo, K., Leppänen, S. P., Karakurt, S., Seppäla, J., Yli-Harja, O., Tammela, T. L. J., Zhang, W., Visakorpi, T. & Nykter, M., 2015, julkaisussa: Cancer Research. 75, 19, s. 4026-4031 6 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  • Prostate Cancer 100%
  • Transcriptome Sequencing 100%
  • Long Non-coding RNA (LncRNA) 100%
  • Long Untranslated RNA 100%
  • RNA Sequencing 100%
  65 Sitaatiot (Scopus)
• 2014

  Protein-protein interaction and coarse grained simulation study of Glioblastoma Multiforme reveals novel pathways of GPR17

  Mutharasu, G., Yli-harja, O. & Kandhavelu, M., 2014, julkaisussa: TASK Quarterly. 18, 4, s. 321-325 5 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Quantitative analysis of colony morphology in yeast

  Ruusuvuori, P., Lin, J., Scott, A., Tan, Z., Sorsa, S., Kallio, A., Nykter, M., Yli-Harja, O., Shmulevich, I. & Dudley, A., 2014, julkaisussa: BioTechniques. 56, 1, s. 18-27 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  18 Sitaatiot (Scopus)

• Robustness of the division symmetry in Escherichia coli and functional consequences of symmetry breaking

  Julkaisun otsikon käännös: Robustness of the division symmetry in Escherichia coli and functional consequences of symmetry breakingGupta, A., Lloyd-Price, J., Oliveira, S. M. D., Yli-Harja, O., Muthukrishnan, A.-B. & Ribeiro, A. S., 2014, julkaisussa: Physical Biology. 11, 6, 066005.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  12 Sitaatiot (Scopus)
• 2013

  A Novel Method for Splitting Clumps of Convex Objects Incorporating Image Intensity and Using Rectangular Window-Based Concavity Point-Pair Search

  Julkaisun otsikon käännös: A Novel Method for Splitting Clumps of Convex Objects Incorporating Image Intensity and Using Rectangular Window-Based Concavity Point-Pair SearchFarhan, M., Yli-Harja, O. & Niemistö, A., 2013, julkaisussa: Pattern Recognition. 46, 3, s. 741-751 11 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Tiedosto

  • Rectangular Window 100%
  • Point Pairs 100%
  • Convex Objects 100%
  • Concavity Point 100%
  • Image Intensity 100%
  49 Sitaatiot (Scopus)

  567 Lataukset (Pure)

• Cell segmentation by multi-resolution analysis and maximum likelihood estimation (MAMLE)

  Julkaisun otsikon käännös: Cell segmentation by multi-resolution analysis and maximum likelihood estimation (MAMLE)Chowdhury, S., Kandhavelu, M., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2013, julkaisussa: BMC Bioinformatics. 14, Suppl 10, s. 1-13 13 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  27 Sitaatiot (Scopus)

• Characterization of aberrant pathways across human cancers

  Ylipää, A., Yli-Harja, O., Zhang, W. & Nykter, M., 2013, julkaisussa: BMC Systems Biology. 7, Supplement 1, s. 1-12 12 Sivumäärä, S1.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  9 Sitaatiot (Scopus)

• Effects of multimerization on the temporal variability of protein complex abundance

  Julkaisun otsikon käännös: Effects of multimerization on the temporal variability of protein complex abundanceHäkkinen, A., Tran, H., Yli-Harja, O., Ingalls, B. & Ribeiro, A. S., 2013, julkaisussa: BMC Systems Biology. 7, Suppl 1, 13 Sivumäärä, S3.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  4 Sitaatiot (Scopus)

• Effects of Rate-Limiting Steps in Transcription Initiation on Genetic Filter Motifs

  Julkaisun otsikon käännös: Effects of Rate-Limiting Steps in Transcription Initiation on Genetic Filter MotifsHäkkinen, A., Tran, H., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2013, julkaisussa: PLoS ONE. 8, 8, s. 1-9 9 Sivumäärä, e70439.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  8 Sitaatiot (Scopus)

• ESTOOLS Data@Hand: human stem cell gene expression resource

  Kong, L., Aho, K.-L., Granberg, K., Lund, R., Järvenpää, L., Seppälä, J., Gokhale, P., Leinonen, K., Hahne, L., Mäkelä, J., Laurila, K., Pukkila, H., Närvä, E., Yli-Harja, O., Andrews, P. W., Nykter, M., Lahesmaa, R., Roos, C. & Autio, R., 2013, julkaisussa: Nature Methods. 10, 9, s. 814-815 2 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen
  5 Sitaatiot (Scopus)

• In vivo single-molecule kinetics of activation and subsequent activity of the arabinose promoter

  Julkaisun otsikon käännös: In vivo single-molecule kinetics of activation and subsequent activity of the arabinose promoterMäkelä, J., Kandhavelu, M., Oliveira, S. M. D., Chandraseelan, J. G., Lloyd-Price, J., Peltonen, J., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2013, julkaisussa: Nucleic Acids Research. 41, 13, s. 6544-6552 9 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  25 Sitaatiot (Scopus)

• Multi-scale Gaussian representation and outline-learning based cell image segmentation

  Julkaisun otsikon käännös: Multi-scale Gaussian representation and outline-learning based cell image segmentationFarhan, M., Ruusuvuori, P., Emmenlauer, M., Rämö, P., Dehio, C. & Yli-Harja, O., 2013, julkaisussa: BMC Bioinformatics. 14, SUPPL10, s. 1-14 14 Sivumäärä, S6.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  7 Sitaatiot (Scopus)

• NanoMiner - Integrative Human Transcriptomics Data Resource for Nanoparticle Research

  Julkaisun otsikon käännös: NanoMiner - Integrative Human Transcriptomics Data Resource for Nanoparticle ResearchKong, L., Tuomela, S., Hahne, L., Ahlfors, H., Yli-Harja, O., Fadeel, B., Lahesmaa, R. & Autio, R., 2013, julkaisussa: PLoS ONE. 8, 7, s. 1-9 9 Sivumäärä, e68414.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  20 Sitaatiot (Scopus)

• Prospecting hydrogen production of Escherichia coli by metabolic network modeling

  Julkaisun otsikon käännös: Prospecting hydrogen production of Escherichia coli by metabolic network modelingSeppälä, J. J., Larjo, A., Aho, T., Yli-Harja, O., Karp, M. T. & Santala, V., 10 syysk. 2013, julkaisussa: International Journal of Hydrogen Energy. 38, 27, s. 11780-11789 10 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  • Escherichia Coli 100%
  • H2 Production 100%
  • Hydrogen Production 100%
  • Metabolic Network Model 100%
  • Flux Balance Analysis 100%
  10 Sitaatiot (Scopus)

• The tumorigenic FGFR3-TACC3 gene fusion escapes miR-99a regulation in glioblastoma

  Parker, C., Annala, M., Cogdell, D., Granberg, K., Sun, Y., Ping, J., Li, X., Xia, L., Gumin, J., Zheng, H., Hu, L., Yli-Harja, O., Haapasalo, H., Visakorpi, T., Liu, X., Liu, C.-G., Sawaya, R., Fuller, G., Chen, K. & Lang, F. & 2 muuta, Nykter, M. & Zhang, W., 2013, julkaisussa: Journal of Clinical Investigation. 123, 2, s. 855-65 11 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  189 Sitaatiot (Scopus)

• Transcriptome and small RNA deep sequencing reveals deregulation of miRNA biogenesis in human glioma

  Moore, M. L., Kivinen, V., Liu, Y., Annala, M., Cogdell, D., Liu, X., Liu, C.-G., Sawaya, R., Yli-Harja, O., Shmulevich, I., Fuller, G. N., Zhang, W. & Nykter, M., 2013, julkaisussa: Journal of Pathology. 229, 3, s. 449-459 11 Sivumäärä, 4109.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  24 Sitaatiot (Scopus)

• ZebIAT, an image analysis tool for registering zebrafish embryos and quantifying cancer metastasis

  Julkaisun otsikon käännös: ZebIAT, an image analysis tool for registering zebrafish embryos and quantifying cancer metastasisAnnila, T., Lihavainen, E., Marques, I. J., Williams, D. R., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2013, julkaisussa: BMC Bioinformatics. 14, Suppl 10, 9 Sivumäärä, S5.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  12 Sitaatiot (Scopus)
• 2012

  An interacting multiple model filter-based autofocus strategy for confocal time-lapse microscopy

  Julkaisun otsikon käännös: An interacting multiple model filter-based autofocus strategy for confocal time-lapse microscopyChowdhury, S., Kandhavelu, M., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa: Journal of Microscopy: Oxford. 245, s. 265-275

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  18 Sitaatiot (Scopus)

• Asymmetric Disposal of Individual Protein Aggregates in Escherichia coli, One Aggregate at a Time

  Julkaisun otsikon käännös: Asymmetric Disposal of Individual Protein Aggregates in Escherichia coli, One Aggregate at a TimeLloyd-Price, J., Häkkinen, A., Kandhavelu, M., Marques, I. J., Chowdhury, S., Lihavainen, E., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa: Journal of Bacteriology. 197, 7, s. 1747-1752

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  24 Sitaatiot (Scopus)

• Dynamics of transcription driven by the tetA promoter, one event at a time, in live Escherichia coli cells

  Julkaisun otsikon käännös: Dynamics of transcription driven by the tetA promoter, one event at a time, in live Escherichia coli cellsMuthukrishnan, A., Kandhavelu, M., Lloyd-Price, J., Kudasov, F., Chowdhury, S., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa: Nucleic Acids Research. 40, 17, s. 8472-8483

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  48 Sitaatiot (Scopus)

• Dynamics of Transcription of Closely Spaced Promoters in Escherichia coli, One Event at a Time

  Julkaisun otsikon käännös: Dynamics of Transcription of Closely Spaced Promoters in Escherichia coli, One Event at a TimeMartins, L., Mäkelä, J., Häkkinen, A., Kandhavelu, M., Yli-Harja, O., Fonseca, J. & Ribeiro, A., 2012, julkaisussa: Journal of Theoretical Biology. 301, s. 83-94

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  4 Sitaatiot (Scopus)

• Effects of Codon Sequence on the Dynamics of Genetic Networks

  Julkaisun otsikon käännös: Effects of Codon Sequence on the Dynamics of Genetic NetworksPotapov, I., Mäkelä, J., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa: Journal of Theoretical Biology. 315, s. 17-25

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  9 Sitaatiot (Scopus)

• Effects of Mg2+ on in vivo transcriptional dynamics of the lar promoter

  Julkaisun otsikon käännös: Effects of Mg2+ on in vivo transcriptional dynamics of the lar promoterKandhavelu, M., Lihavainen, E., Muthukrishnan, A., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A., 2012, julkaisussa: Biosystems. 107, 3, s. 129-134

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  9 Sitaatiot (Scopus)

• Probabilistic RNA partitioning generates transient increases in the normalized variance of RNA numbers in synchronized populations of Escherichia coli

  Julkaisun otsikon käännös: Probabilistic RNA partitioning generates transient increases in the normalized variance of RNA numbers in synchronized populations of Escherichia coliLloyd-Price, J., Lehtivaara, M., Kandhavelu, M., Chowdhury, S., Muthukrishnan, A.-B., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa: Molecular Biosystems. 8, s. 565-571

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  16 Sitaatiot (Scopus)

• Regulation of Mean and Noise of the in Vivo Kinetics of Transcription Under the Control of the lac/ara-1 Promoter

  Julkaisun otsikon käännös: Regulation of Mean and Noise of the in Vivo Kinetics of Transcription Under the Control of the lac/ara-1 PromoterKandhavelu, M., Lloyd-Price, J., Gupta, A., Muthukrishnan, A.-B., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa: FEBS Letters. 586, 21, s. 3870-3875

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  20 Sitaatiot (Scopus)

• Single-molecule dynamics of transcription of the lar promoter

  Julkaisun otsikon käännös: Single-molecule dynamics of transcription of the lar promoterKandhavelu, M., Häkkinen, A., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A., 2012, julkaisussa: Physical Biology. 9, 2, s. 1-7 7 Sivumäärä, 026004.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  36 Sitaatiot (Scopus)

• Synthesis, characterization and antimicrobial activity of arylhydrazones of methylene active compounds

  Julkaisun otsikon käännös: Synthesis, characterization and antimicrobial activity of arylhydrazones of methylene active compoundsKandhavelu, M., Paturu, L., Mizar, A., Mahmudov, K. T., Kopylovich, M. N., Karp, M., Yli-Harja, O., Pombeiro, A. J. L. & Ribeiro, A. S., 2012, julkaisussa: Pharmaceutical Chemistry Journal. 46, 3, s. 157-164

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  15 Sitaatiot (Scopus)
• 2011

  A Beta-mixture model for dimensionality reduction, sample classification and analysis

  Julkaisun otsikon käännös: A Beta-mixture model for dimensionality reduction, sample classification and analysisLaurila, K., Osre, B., Andersen, C. L., Lamy, P., Orntoft, T., Yli-Harja, O. & Wiuf, C., 2011, julkaisussa: BMC Bioinformatics. 12, s. 1-6 6 Sivumäärä, 215.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  11 Sitaatiot (Scopus)

• A systems biological approach to identify key transcription factors and their genomic neighborhoods in human sarcomas

  Julkaisun otsikon käännös: A systems biological approach to identify key transcription factors and their genomic neighborhoods in human sarcomasYlipää, A., Yli-Harja, O., Zhang, W. & Nykter, M., 2011, julkaisussa: Chinese Journal of Cancer. 30, 1, s. 27-40

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  5 Sitaatiot (Scopus)

• Automatic detection of changes in the dynamics of delayed stochastic gene networks and in vivo production of RNA molecules in Escherichia coli

  Julkaisun otsikon käännös: Automatic detection of changes in the dynamics of delayed stochastic gene networks and in vivo production of RNA molecules in Escherichia coliMäkelä, J., Huttunen, H., Kandhavelu, M., Yli-Harja, O. & Ribeiro, A. S., 2011, julkaisussa: Bioinformatics. 27, 19, s. 2714-2720

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  4 Sitaatiot (Scopus)

• Cancer Systems Biology: Signal Processing for Cancer Research

  Yli-Harja, O., Ylipää, A., Nykter, M. & Zhang, W., 2011, julkaisussa: Chinese Journal of Cancer. 30, 4, s. 221-225

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  4 Sitaatiot (Scopus)

• Cell-to-cell diversity in protein levels of a gene driven by a tetracycline inducible promoter

  Julkaisun otsikon käännös: Cell-to-cell diversity in protein levels of a gene driven by a tetracycline inducible promoterSmolander, O.-P., Kandhavelu, M., Mannerström, H., Lihavainen, E., Kalaichelvan, S., Healy, S., Yli-Harja, O., Karp, M. & Ribeiro, A. S., 2011, julkaisussa: BMC Molecular Biology. 12, s. 1-27 27 Sivumäärä, 21.

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  3 Sitaatiot (Scopus)

• Diversity of temporal correlations between genes in models of noisy and noiseless gene networks

  Julkaisun otsikon käännös: Diversity of temporal correlations between genes in models of noisy and noiseless gene networksRibeiro, A. S., Lloyd-Price, J., Chowdhury, S. & Yli-Harja, O., 2011, julkaisussa: Biosystems. 104, 2-3, s. 136-144

  Tutkimustuotos: Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
  3 Sitaatiot (Scopus)