Siirry päänavigointiin Siirry hakuun Siirry pääsisältöön

Configurational Disorder of Water Hydrogen-Bond Network at the Protein Dynamical Transition

  • Obaidur Rahaman*
  • , Maria Kalimeri
  • , Marina Katava
  • , Alessandro Paciaroni
  • , Fabio Sterpone
  • *Tämän työn vastaava kirjoittaja

    Tutkimustuotos: ArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

    10 Sitaatiot (Scopus)

    Abstrakti

    We introduce a novel strategy to quantify the disorder of extended water-water hydrogen-bond (HB) networks sampled in particle-based computer simulations. The method relies on the conformational clustering of the HB connectivity states. We successfully applied it to unveil the fine relationship among the protein dynamical transition in hydrated powder, which marks the activation of protein flexibility at Td ≈ 240 K, and the sudden increase in the configurational disorder of the water HB network enveloping the proteins. Our finding links, in the spirit of the Adam-Gibbs relationship, the diffusivity of protein atoms, as quantified by the hydrogen mean-square displacements, and the thermodynamic solvent configurational entropy.

    AlkuperäiskieliEnglanti
    Sivut6792-6798
    Sivumäärä7
    JulkaisuJournal of Physical Chemistry B
    Vuosikerta121
    Numero28
    DOI - pysyväislinkit
    TilaJulkaistu - 20 heinäk. 2017
    OKM-julkaisutyyppiA1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

    Julkaisufoorumi-taso

    • Jufo-taso 1

    !!ASJC Scopus subject areas

    • Surfaces, Coatings and Films
    • Physical and Theoretical Chemistry
    • Materials Chemistry

    Sormenjälki

    Sukella tutkimusaiheisiin 'Configurational Disorder of Water Hydrogen-Bond Network at the Protein Dynamical Transition'. Ne muodostavat yhdessä ainutlaatuisen sormenjäljen.

    Siteeraa tätä